Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpd52Q62393 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpd52Q62393 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpd52Q62393 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpd52Q62393 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpd52Q62393 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpd52Q62393 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpd52Q62393 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpd52Q62393 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpd52Q62393 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpd52Q62393 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpd52Q62393 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpd52Q62393 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tpd52Q62393 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tpd52Q62393 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tpd52Q62393 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tpd52Q62393 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tpd52Q62393 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tpd52Q62393 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tpd52Q62393 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpd52Q62393 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpd52Q62393 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpd52Q62393 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpd52Q62393 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpd52Q62393 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpd52Q62393 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpd52Q62393 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpd52Q62393 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpd52Q62393 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpd52Q62393 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpd52Q62393 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpd52Q62393 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpd52Q62393 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpd52Q62393 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpd52Q62393 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpd52Q62393 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpd52Q62393 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpd52Q62393 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpd52Q62393 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpd52Q62393 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpd52Q62393 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpd52Q62393 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpd52Q62393 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpd52Q62393 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpd52Q62393 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpd52Q62393 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpd52Q62393 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpd52Q62393 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpd52Q62393 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpd52Q62393 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpd52Q62393 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpd52Q62393 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpd52Q62393 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpd52Q62393 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tpd52Q62393 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tpd52Q62393 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tpd52Q62393 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tpd52Q62393 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tpd52Q62393 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tpd52Q62393 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tpd52Q62393 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tpd52Q62393 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tpd52Q62393 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tpd52Q62393 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpd52Q62393 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpd52Q62393 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpd52Q62393 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpd52Q62393 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpd52Q62393 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpd52Q62393 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tpd52Q62393 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpd52Q62393 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpd52Q62393 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpd52Q62393 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpd52Q62393 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpd52Q62393 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpd52Q62393 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpd52Q62393 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpd52Q62393 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tpd52Q62393 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpd52Q62393 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpd52Q62393 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpd52Q62393 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpd52Q62393 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpd52Q62393 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpd52Q62393 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpd52Q62393 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tpd52Q62393 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpd52Q62393 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpd52Q62393 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpd52Q62393 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpd52Q62393 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpd52Q62393 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpd52Q62393 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpd52Q62393 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpd52Q62393 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpd52Q62393 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tpd52Q62393 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpd52Q62393 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpd52Q62393 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms