Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SnrpcQ62241 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SnrpcQ62241 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms