Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

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Length 751 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sema3cQ62181 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Sema3cQ62181 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms