Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gli3Q61602 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Gli3Q61602 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Gli3Q61602 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gli3Q61602 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Gli3Q61602 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gli3Q61602 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Gli3Q61602 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Gli3Q61602 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gli3Q61602 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gli3Q61602 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Gli3Q61602 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Gli3Q61602 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Gli3Q61602 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gli3Q61602 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Gli3Q61602 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gli3Q61602 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.54■■■□□ 2
Gli3Q61602 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gli3Q61602 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gli3Q61602 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Gli3Q61602 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gli3Q61602 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gli3Q61602 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gli3Q61602 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gli3Q61602 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gli3Q61602 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Gli3Q61602 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Gli3Q61602 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gli3Q61602 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Gli3Q61602 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Gli3Q61602 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gli3Q61602 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Gli3Q61602 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gli3Q61602 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gli3Q61602 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gli3Q61602 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gli3Q61602 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gli3Q61602 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gli3Q61602 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Gli3Q61602 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gli3Q61602 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gli3Q61602 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gli3Q61602 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gli3Q61602 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Gli3Q61602 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gli3Q61602 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gli3Q61602 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Gli3Q61602 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gli3Q61602 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gli3Q61602 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gli3Q61602 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gli3Q61602 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gli3Q61602 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gli3Q61602 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gli3Q61602 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gli3Q61602 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gli3Q61602 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gli3Q61602 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gli3Q61602 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gli3Q61602 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gli3Q61602 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gli3Q61602 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gli3Q61602 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gli3Q61602 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gli3Q61602 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Gli3Q61602 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gli3Q61602 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gli3Q61602 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gli3Q61602 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gli3Q61602 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gli3Q61602 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gli3Q61602 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gli3Q61602 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gli3Q61602 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Gli3Q61602 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Gli3Q61602 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Gli3Q61602 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Gli3Q61602 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Gli3Q61602 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Gli3Q61602 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gli3Q61602 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gli3Q61602 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gli3Q61602 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gli3Q61602 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gli3Q61602 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gli3Q61602 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gli3Q61602 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gli3Q61602 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gli3Q61602 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gli3Q61602 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gli3Q61602 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gli3Q61602 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gli3Q61602 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gli3Q61602 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gli3Q61602 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gli3Q61602 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gli3Q61602 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gli3Q61602 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gli3Q61602 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gli3Q61602 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms