Protein–RNA interactions for Protein: Q61575

Foxn1, Forkhead box protein N1, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn1Q61575 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Foxn1Q61575 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Foxn1Q61575 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Foxn1Q61575 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Foxn1Q61575 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Foxn1Q61575 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Foxn1Q61575 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Foxn1Q61575 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Foxn1Q61575 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Foxn1Q61575 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Foxn1Q61575 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Foxn1Q61575 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Foxn1Q61575 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Foxn1Q61575 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Foxn1Q61575 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Foxn1Q61575 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Foxn1Q61575 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Foxn1Q61575 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Foxn1Q61575 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Foxn1Q61575 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Foxn1Q61575 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Foxn1Q61575 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Foxn1Q61575 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Foxn1Q61575 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Foxn1Q61575 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Foxn1Q61575 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Foxn1Q61575 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Foxn1Q61575 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Foxn1Q61575 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Foxn1Q61575 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Foxn1Q61575 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Foxn1Q61575 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Foxn1Q61575 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Foxn1Q61575 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Foxn1Q61575 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Foxn1Q61575 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Foxn1Q61575 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Foxn1Q61575 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Foxn1Q61575 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Foxn1Q61575 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Foxn1Q61575 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Foxn1Q61575 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Foxn1Q61575 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Foxn1Q61575 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Foxn1Q61575 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Foxn1Q61575 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Foxn1Q61575 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Foxn1Q61575 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Foxn1Q61575 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Foxn1Q61575 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Foxn1Q61575 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Foxn1Q61575 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Foxn1Q61575 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Foxn1Q61575 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Foxn1Q61575 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Foxn1Q61575 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Foxn1Q61575 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Foxn1Q61575 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Foxn1Q61575 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Foxn1Q61575 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Foxn1Q61575 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Foxn1Q61575 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Foxn1Q61575 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Foxn1Q61575 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Foxn1Q61575 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Foxn1Q61575 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Foxn1Q61575 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Foxn1Q61575 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Foxn1Q61575 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Foxn1Q61575 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Foxn1Q61575 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Foxn1Q61575 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Foxn1Q61575 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Foxn1Q61575 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Foxn1Q61575 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Foxn1Q61575 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Foxn1Q61575 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Foxn1Q61575 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Foxn1Q61575 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Foxn1Q61575 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Foxn1Q61575 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Foxn1Q61575 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Foxn1Q61575 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Foxn1Q61575 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Foxn1Q61575 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Foxn1Q61575 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Foxn1Q61575 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Foxn1Q61575 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Foxn1Q61575 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Foxn1Q61575 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Foxn1Q61575 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Foxn1Q61575 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Foxn1Q61575 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Foxn1Q61575 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Foxn1Q61575 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Foxn1Q61575 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Foxn1Q61575 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Foxn1Q61575 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Foxn1Q61575 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Foxn1Q61575 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms