Protein–RNA interactions for Protein: Q61371

Ift88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 824 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift88Q61371 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ift88Q61371 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Ift88Q61371 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ift88Q61371 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ift88Q61371 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ift88Q61371 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Ift88Q61371 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Ift88Q61371 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Ift88Q61371 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ift88Q61371 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Ift88Q61371 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Ift88Q61371 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ift88Q61371 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Ift88Q61371 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ift88Q61371 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ift88Q61371 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ift88Q61371 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ift88Q61371 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ift88Q61371 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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Ift88Q61371 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ift88Q61371 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ift88Q61371 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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Ift88Q61371 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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Ift88Q61371 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ift88Q61371 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ift88Q61371 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Ift88Q61371 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Ift88Q61371 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Ift88Q61371 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ift88Q61371 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ift88Q61371 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ift88Q61371 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ift88Q61371 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ift88Q61371 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ift88Q61371 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ift88Q61371 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ift88Q61371 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ift88Q61371 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ift88Q61371 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ift88Q61371 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ift88Q61371 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ift88Q61371 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ift88Q61371 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
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Ift88Q61371 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ift88Q61371 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
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Ift88Q61371 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ift88Q61371 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
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