Protein–RNA interactions for Protein: Q61282

Acan, Aggrecan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AcanQ61282 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AcanQ61282 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AcanQ61282 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AcanQ61282 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AcanQ61282 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AcanQ61282 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AcanQ61282 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AcanQ61282 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AcanQ61282 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms