Protein–RNA interactions for Protein: Q61143

Trpc6, Short transient receptor potential channel 6, mousemouse

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Length 930 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc6Q61143 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpc6Q61143 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpc6Q61143 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpc6Q61143 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpc6Q61143 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpc6Q61143 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpc6Q61143 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpc6Q61143 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpc6Q61143 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpc6Q61143 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpc6Q61143 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpc6Q61143 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpc6Q61143 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpc6Q61143 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpc6Q61143 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpc6Q61143 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpc6Q61143 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpc6Q61143 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpc6Q61143 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpc6Q61143 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpc6Q61143 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpc6Q61143 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpc6Q61143 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpc6Q61143 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpc6Q61143 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpc6Q61143 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpc6Q61143 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpc6Q61143 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpc6Q61143 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpc6Q61143 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpc6Q61143 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpc6Q61143 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpc6Q61143 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trpc6Q61143 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trpc6Q61143 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trpc6Q61143 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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Trpc6Q61143 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpc6Q61143 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
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