Protein–RNA interactions for Protein: Q61080

Foxf1, Forkhead box protein F1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxf1Q61080 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxf1Q61080 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxf1Q61080 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Foxf1Q61080 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Foxf1Q61080 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Foxf1Q61080 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Foxf1Q61080 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Foxf1Q61080 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Foxf1Q61080 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Foxf1Q61080 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Foxf1Q61080 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Foxf1Q61080 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms