Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Foxd3Q61060 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxd3Q61060 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms