Protein–RNA interactions for Protein: Q60987

Foxg1, Forkhead box protein G1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxg1Q60987 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Foxg1Q60987 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Foxg1Q60987 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms