Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
JrkQ60976 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
JrkQ60976 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
JrkQ60976 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
JrkQ60976 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
JrkQ60976 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
JrkQ60976 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
JrkQ60976 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
JrkQ60976 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
JrkQ60976 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
JrkQ60976 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
JrkQ60976 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
JrkQ60976 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
JrkQ60976 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
JrkQ60976 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
JrkQ60976 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
JrkQ60976 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
JrkQ60976 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
JrkQ60976 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
JrkQ60976 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
JrkQ60976 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
JrkQ60976 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
JrkQ60976 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
JrkQ60976 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
JrkQ60976 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
JrkQ60976 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
JrkQ60976 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
JrkQ60976 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
JrkQ60976 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
JrkQ60976 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
JrkQ60976 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
JrkQ60976 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
JrkQ60976 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
JrkQ60976 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
JrkQ60976 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
JrkQ60976 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
JrkQ60976 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
JrkQ60976 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
JrkQ60976 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
JrkQ60976 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
JrkQ60976 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
JrkQ60976 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
JrkQ60976 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
JrkQ60976 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
JrkQ60976 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
JrkQ60976 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
JrkQ60976 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
JrkQ60976 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
JrkQ60976 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
JrkQ60976 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
JrkQ60976 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
JrkQ60976 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
JrkQ60976 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
JrkQ60976 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
JrkQ60976 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
JrkQ60976 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
JrkQ60976 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms