Protein–RNA interactions for Protein: Q60932

Vdac1, Voltage-dependent anion-selective channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vdac1Q60932 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vdac1Q60932 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vdac1Q60932 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vdac1Q60932 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vdac1Q60932 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vdac1Q60932 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vdac1Q60932 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vdac1Q60932 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vdac1Q60932 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vdac1Q60932 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vdac1Q60932 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vdac1Q60932 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vdac1Q60932 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vdac1Q60932 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vdac1Q60932 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vdac1Q60932 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vdac1Q60932 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vdac1Q60932 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vdac1Q60932 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vdac1Q60932 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vdac1Q60932 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vdac1Q60932 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vdac1Q60932 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vdac1Q60932 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vdac1Q60932 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms