Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ppp1r1bQ60829 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppp1r1bQ60829 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppp1r1bQ60829 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppp1r1bQ60829 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ppp1r1bQ60829 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppp1r1bQ60829 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppp1r1bQ60829 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppp1r1bQ60829 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppp1r1bQ60829 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppp1r1bQ60829 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppp1r1bQ60829 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppp1r1bQ60829 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppp1r1bQ60829 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppp1r1bQ60829 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppp1r1bQ60829 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ppp1r1bQ60829 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppp1r1bQ60829 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppp1r1bQ60829 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppp1r1bQ60829 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppp1r1bQ60829 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppp1r1bQ60829 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppp1r1bQ60829 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppp1r1bQ60829 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppp1r1bQ60829 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppp1r1bQ60829 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppp1r1bQ60829 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppp1r1bQ60829 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppp1r1bQ60829 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppp1r1bQ60829 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppp1r1bQ60829 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppp1r1bQ60829 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppp1r1bQ60829 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ppp1r1bQ60829 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppp1r1bQ60829 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppp1r1bQ60829 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppp1r1bQ60829 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppp1r1bQ60829 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppp1r1bQ60829 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppp1r1bQ60829 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ppp1r1bQ60829 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppp1r1bQ60829 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppp1r1bQ60829 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppp1r1bQ60829 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppp1r1bQ60829 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ppp1r1bQ60829 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ppp1r1bQ60829 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppp1r1bQ60829 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppp1r1bQ60829 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppp1r1bQ60829 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppp1r1bQ60829 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppp1r1bQ60829 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ppp1r1bQ60829 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppp1r1bQ60829 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppp1r1bQ60829 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppp1r1bQ60829 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppp1r1bQ60829 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppp1r1bQ60829 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppp1r1bQ60829 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppp1r1bQ60829 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppp1r1bQ60829 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppp1r1bQ60829 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppp1r1bQ60829 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ppp1r1bQ60829 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppp1r1bQ60829 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppp1r1bQ60829 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppp1r1bQ60829 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppp1r1bQ60829 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppp1r1bQ60829 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppp1r1bQ60829 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppp1r1bQ60829 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppp1r1bQ60829 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppp1r1bQ60829 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppp1r1bQ60829 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppp1r1bQ60829 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppp1r1bQ60829 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppp1r1bQ60829 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ppp1r1bQ60829 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppp1r1bQ60829 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppp1r1bQ60829 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppp1r1bQ60829 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppp1r1bQ60829 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppp1r1bQ60829 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppp1r1bQ60829 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppp1r1bQ60829 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppp1r1bQ60829 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppp1r1bQ60829 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppp1r1bQ60829 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ppp1r1bQ60829 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppp1r1bQ60829 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppp1r1bQ60829 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppp1r1bQ60829 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppp1r1bQ60829 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ppp1r1bQ60829 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppp1r1bQ60829 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppp1r1bQ60829 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppp1r1bQ60829 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppp1r1bQ60829 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppp1r1bQ60829 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ppp1r1bQ60829 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms