Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Epha1Q60750 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Epha1Q60750 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Epha1Q60750 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Epha1Q60750 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha1Q60750 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha1Q60750 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha1Q60750 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha1Q60750 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha1Q60750 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha1Q60750 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha1Q60750 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha1Q60750 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha1Q60750 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha1Q60750 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha1Q60750 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha1Q60750 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha1Q60750 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha1Q60750 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha1Q60750 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha1Q60750 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha1Q60750 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epha1Q60750 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epha1Q60750 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epha1Q60750 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epha1Q60750 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epha1Q60750 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epha1Q60750 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epha1Q60750 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epha1Q60750 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epha1Q60750 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epha1Q60750 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Epha1Q60750 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epha1Q60750 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epha1Q60750 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epha1Q60750 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epha1Q60750 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epha1Q60750 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epha1Q60750 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epha1Q60750 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epha1Q60750 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms