Protein–RNA interactions for Protein: Q60720

Cyb561, Cytochrome b561, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb561Q60720 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyb561Q60720 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyb561Q60720 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyb561Q60720 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyb561Q60720 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyb561Q60720 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyb561Q60720 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyb561Q60720 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cyb561Q60720 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyb561Q60720 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyb561Q60720 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyb561Q60720 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyb561Q60720 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyb561Q60720 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyb561Q60720 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cyb561Q60720 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyb561Q60720 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyb561Q60720 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyb561Q60720 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyb561Q60720 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyb561Q60720 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyb561Q60720 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cyb561Q60720 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyb561Q60720 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyb561Q60720 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyb561Q60720 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyb561Q60720 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyb561Q60720 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyb561Q60720 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyb561Q60720 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyb561Q60720 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyb561Q60720 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyb561Q60720 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cyb561Q60720 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyb561Q60720 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyb561Q60720 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyb561Q60720 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyb561Q60720 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cyb561Q60720 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cyb561Q60720 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms