Protein–RNA interactions for Protein: Q60687

Fshb, Follitropin subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FshbQ60687 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FshbQ60687 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FshbQ60687 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FshbQ60687 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FshbQ60687 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FshbQ60687 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FshbQ60687 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FshbQ60687 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FshbQ60687 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FshbQ60687 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FshbQ60687 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FshbQ60687 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FshbQ60687 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FshbQ60687 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FshbQ60687 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FshbQ60687 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FshbQ60687 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FshbQ60687 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FshbQ60687 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FshbQ60687 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FshbQ60687 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FshbQ60687 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FshbQ60687 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FshbQ60687 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FshbQ60687 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FshbQ60687 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FshbQ60687 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FshbQ60687 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FshbQ60687 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FshbQ60687 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FshbQ60687 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FshbQ60687 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FshbQ60687 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FshbQ60687 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FshbQ60687 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FshbQ60687 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FshbQ60687 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FshbQ60687 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FshbQ60687 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FshbQ60687 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FshbQ60687 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FshbQ60687 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FshbQ60687 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FshbQ60687 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FshbQ60687 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FshbQ60687 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FshbQ60687 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FshbQ60687 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FshbQ60687 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FshbQ60687 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FshbQ60687 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FshbQ60687 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FshbQ60687 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FshbQ60687 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FshbQ60687 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FshbQ60687 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FshbQ60687 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FshbQ60687 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FshbQ60687 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FshbQ60687 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FshbQ60687 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FshbQ60687 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FshbQ60687 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FshbQ60687 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FshbQ60687 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FshbQ60687 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FshbQ60687 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FshbQ60687 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FshbQ60687 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FshbQ60687 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FshbQ60687 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FshbQ60687 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FshbQ60687 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FshbQ60687 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FshbQ60687 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FshbQ60687 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FshbQ60687 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FshbQ60687 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FshbQ60687 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FshbQ60687 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FshbQ60687 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FshbQ60687 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FshbQ60687 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FshbQ60687 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FshbQ60687 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FshbQ60687 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FshbQ60687 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FshbQ60687 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FshbQ60687 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FshbQ60687 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FshbQ60687 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FshbQ60687 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FshbQ60687 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FshbQ60687 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FshbQ60687 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FshbQ60687 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FshbQ60687 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FshbQ60687 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FshbQ60687 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FshbQ60687 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms