Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ItgaeQ60677 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ItgaeQ60677 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ItgaeQ60677 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ItgaeQ60677 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ItgaeQ60677 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ItgaeQ60677 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ItgaeQ60677 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ItgaeQ60677 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ItgaeQ60677 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ItgaeQ60677 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ItgaeQ60677 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ItgaeQ60677 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ItgaeQ60677 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ItgaeQ60677 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ItgaeQ60677 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ItgaeQ60677 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ItgaeQ60677 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ItgaeQ60677 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ItgaeQ60677 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ItgaeQ60677 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ItgaeQ60677 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ItgaeQ60677 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ItgaeQ60677 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ItgaeQ60677 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ItgaeQ60677 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ItgaeQ60677 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ItgaeQ60677 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ItgaeQ60677 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ItgaeQ60677 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ItgaeQ60677 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ItgaeQ60677 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ItgaeQ60677 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ItgaeQ60677 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ItgaeQ60677 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ItgaeQ60677 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ItgaeQ60677 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ItgaeQ60677 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ItgaeQ60677 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ItgaeQ60677 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ItgaeQ60677 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ItgaeQ60677 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms