Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp13a3Q5XF89 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp13a3Q5XF89 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp13a3Q5XF89 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp13a3Q5XF89 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp13a3Q5XF89 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp13a3Q5XF89 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp13a3Q5XF89 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp13a3Q5XF89 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp13a3Q5XF89 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp13a3Q5XF89 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp13a3Q5XF89 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp13a3Q5XF89 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp13a3Q5XF89 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp13a3Q5XF89 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp13a3Q5XF89 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp13a3Q5XF89 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp13a3Q5XF89 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp13a3Q5XF89 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp13a3Q5XF89 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp13a3Q5XF89 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp13a3Q5XF89 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp13a3Q5XF89 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp13a3Q5XF89 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp13a3Q5XF89 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp13a3Q5XF89 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp13a3Q5XF89 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp13a3Q5XF89 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp13a3Q5XF89 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp13a3Q5XF89 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp13a3Q5XF89 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp13a3Q5XF89 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp13a3Q5XF89 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp13a3Q5XF89 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp13a3Q5XF89 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp13a3Q5XF89 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp13a3Q5XF89 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp13a3Q5XF89 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp13a3Q5XF89 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp13a3Q5XF89 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp13a3Q5XF89 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp13a3Q5XF89 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp13a3Q5XF89 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp13a3Q5XF89 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp13a3Q5XF89 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp13a3Q5XF89 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp13a3Q5XF89 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp13a3Q5XF89 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp13a3Q5XF89 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp13a3Q5XF89 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp13a3Q5XF89 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp13a3Q5XF89 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms