Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Scaf1Q5U4C3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Scaf1Q5U4C3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Scaf1Q5U4C3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Scaf1Q5U4C3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Scaf1Q5U4C3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Scaf1Q5U4C3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Scaf1Q5U4C3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Scaf1Q5U4C3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Scaf1Q5U4C3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Scaf1Q5U4C3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Scaf1Q5U4C3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Scaf1Q5U4C3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Scaf1Q5U4C3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Scaf1Q5U4C3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Scaf1Q5U4C3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Scaf1Q5U4C3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Scaf1Q5U4C3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Scaf1Q5U4C3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Scaf1Q5U4C3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Scaf1Q5U4C3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Scaf1Q5U4C3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Scaf1Q5U4C3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Scaf1Q5U4C3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Scaf1Q5U4C3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Scaf1Q5U4C3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Scaf1Q5U4C3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Scaf1Q5U4C3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Scaf1Q5U4C3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Scaf1Q5U4C3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Scaf1Q5U4C3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Scaf1Q5U4C3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Scaf1Q5U4C3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Scaf1Q5U4C3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Scaf1Q5U4C3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Scaf1Q5U4C3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Scaf1Q5U4C3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Scaf1Q5U4C3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Scaf1Q5U4C3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Scaf1Q5U4C3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Scaf1Q5U4C3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Scaf1Q5U4C3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Scaf1Q5U4C3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Scaf1Q5U4C3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Scaf1Q5U4C3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Scaf1Q5U4C3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Scaf1Q5U4C3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Scaf1Q5U4C3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Scaf1Q5U4C3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Scaf1Q5U4C3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Scaf1Q5U4C3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Scaf1Q5U4C3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Scaf1Q5U4C3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Scaf1Q5U4C3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Scaf1Q5U4C3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Scaf1Q5U4C3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Scaf1Q5U4C3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Scaf1Q5U4C3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Scaf1Q5U4C3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Scaf1Q5U4C3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Scaf1Q5U4C3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Scaf1Q5U4C3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Scaf1Q5U4C3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Scaf1Q5U4C3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Scaf1Q5U4C3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Scaf1Q5U4C3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Scaf1Q5U4C3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Scaf1Q5U4C3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Scaf1Q5U4C3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Scaf1Q5U4C3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Scaf1Q5U4C3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Scaf1Q5U4C3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Scaf1Q5U4C3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Scaf1Q5U4C3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Scaf1Q5U4C3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Scaf1Q5U4C3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Scaf1Q5U4C3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Scaf1Q5U4C3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Scaf1Q5U4C3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Scaf1Q5U4C3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Scaf1Q5U4C3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Scaf1Q5U4C3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Scaf1Q5U4C3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Scaf1Q5U4C3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Scaf1Q5U4C3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Scaf1Q5U4C3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Scaf1Q5U4C3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Scaf1Q5U4C3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Scaf1Q5U4C3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Scaf1Q5U4C3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Scaf1Q5U4C3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Scaf1Q5U4C3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Scaf1Q5U4C3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Scaf1Q5U4C3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Scaf1Q5U4C3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Scaf1Q5U4C3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Scaf1Q5U4C3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Scaf1Q5U4C3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Scaf1Q5U4C3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Scaf1Q5U4C3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms