Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Tsr1Q5SWD9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tsr1Q5SWD9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tsr1Q5SWD9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms