Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW45

Mks1, Meckel syndrome type 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mks1Q5SW45 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Mks1Q5SW45 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mks1Q5SW45 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mks1Q5SW45 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms