Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bbs12Q5SUD9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Bbs12Q5SUD9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms