Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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Sco1Q5SUC9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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Sco1Q5SUC9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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Sco1Q5SUC9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sco1Q5SUC9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sco1Q5SUC9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sco1Q5SUC9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sco1Q5SUC9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sco1Q5SUC9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sco1Q5SUC9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sco1Q5SUC9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sco1Q5SUC9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sco1Q5SUC9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sco1Q5SUC9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sco1Q5SUC9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sco1Q5SUC9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sco1Q5SUC9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sco1Q5SUC9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sco1Q5SUC9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sco1Q5SUC9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sco1Q5SUC9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sco1Q5SUC9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sco1Q5SUC9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sco1Q5SUC9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sco1Q5SUC9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sco1Q5SUC9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sco1Q5SUC9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sco1Q5SUC9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.4 ms