Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

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Length 820 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Scarf1Q5ND28 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scarf1Q5ND28 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scarf1Q5ND28 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scarf1Q5ND28 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scarf1Q5ND28 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scarf1Q5ND28 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scarf1Q5ND28 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Scarf1Q5ND28 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scarf1Q5ND28 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scarf1Q5ND28 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scarf1Q5ND28 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scarf1Q5ND28 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Scarf1Q5ND28 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scarf1Q5ND28 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scarf1Q5ND28 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scarf1Q5ND28 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scarf1Q5ND28 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scarf1Q5ND28 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Scarf1Q5ND28 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scarf1Q5ND28 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scarf1Q5ND28 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scarf1Q5ND28 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scarf1Q5ND28 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scarf1Q5ND28 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scarf1Q5ND28 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scarf1Q5ND28 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scarf1Q5ND28 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scarf1Q5ND28 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scarf1Q5ND28 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Scarf1Q5ND28 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Scarf1Q5ND28 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scarf1Q5ND28 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Scarf1Q5ND28 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scarf1Q5ND28 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scarf1Q5ND28 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scarf1Q5ND28 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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