Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCR9

Nsrp1, Nuclear speckle splicing regulatory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsrp1Q5NCR9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nsrp1Q5NCR9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nsrp1Q5NCR9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nsrp1Q5NCR9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nsrp1Q5NCR9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nsrp1Q5NCR9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nsrp1Q5NCR9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nsrp1Q5NCR9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nsrp1Q5NCR9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nsrp1Q5NCR9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nsrp1Q5NCR9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nsrp1Q5NCR9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nsrp1Q5NCR9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nsrp1Q5NCR9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nsrp1Q5NCR9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nsrp1Q5NCR9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nsrp1Q5NCR9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nsrp1Q5NCR9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nsrp1Q5NCR9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nsrp1Q5NCR9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nsrp1Q5NCR9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nsrp1Q5NCR9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nsrp1Q5NCR9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nsrp1Q5NCR9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nsrp1Q5NCR9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nsrp1Q5NCR9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nsrp1Q5NCR9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nsrp1Q5NCR9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nsrp1Q5NCR9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nsrp1Q5NCR9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nsrp1Q5NCR9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nsrp1Q5NCR9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Nsrp1Q5NCR9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nsrp1Q5NCR9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nsrp1Q5NCR9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nsrp1Q5NCR9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nsrp1Q5NCR9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nsrp1Q5NCR9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Nsrp1Q5NCR9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nsrp1Q5NCR9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nsrp1Q5NCR9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nsrp1Q5NCR9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nsrp1Q5NCR9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nsrp1Q5NCR9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nsrp1Q5NCR9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nsrp1Q5NCR9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nsrp1Q5NCR9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nsrp1Q5NCR9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nsrp1Q5NCR9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nsrp1Q5NCR9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nsrp1Q5NCR9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nsrp1Q5NCR9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nsrp1Q5NCR9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nsrp1Q5NCR9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nsrp1Q5NCR9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nsrp1Q5NCR9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nsrp1Q5NCR9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nsrp1Q5NCR9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nsrp1Q5NCR9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nsrp1Q5NCR9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nsrp1Q5NCR9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nsrp1Q5NCR9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nsrp1Q5NCR9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nsrp1Q5NCR9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nsrp1Q5NCR9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nsrp1Q5NCR9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nsrp1Q5NCR9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nsrp1Q5NCR9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nsrp1Q5NCR9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nsrp1Q5NCR9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nsrp1Q5NCR9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nsrp1Q5NCR9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nsrp1Q5NCR9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nsrp1Q5NCR9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nsrp1Q5NCR9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nsrp1Q5NCR9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nsrp1Q5NCR9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nsrp1Q5NCR9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nsrp1Q5NCR9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nsrp1Q5NCR9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nsrp1Q5NCR9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nsrp1Q5NCR9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nsrp1Q5NCR9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nsrp1Q5NCR9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nsrp1Q5NCR9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nsrp1Q5NCR9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nsrp1Q5NCR9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nsrp1Q5NCR9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nsrp1Q5NCR9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nsrp1Q5NCR9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nsrp1Q5NCR9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nsrp1Q5NCR9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nsrp1Q5NCR9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nsrp1Q5NCR9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nsrp1Q5NCR9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nsrp1Q5NCR9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nsrp1Q5NCR9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nsrp1Q5NCR9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nsrp1Q5NCR9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nsrp1Q5NCR9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms