Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Trim41Q5NCC3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Trim41Q5NCC3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Trim41Q5NCC3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Trim41Q5NCC3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Trim41Q5NCC3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Trim41Q5NCC3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Trim41Q5NCC3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Trim41Q5NCC3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Trim41Q5NCC3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Trim41Q5NCC3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Trim41Q5NCC3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Trim41Q5NCC3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Trim41Q5NCC3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Trim41Q5NCC3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Trim41Q5NCC3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Trim41Q5NCC3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Trim41Q5NCC3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Trim41Q5NCC3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Trim41Q5NCC3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Trim41Q5NCC3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Trim41Q5NCC3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
Trim41Q5NCC3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Trim41Q5NCC3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Trim41Q5NCC3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Trim41Q5NCC3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Trim41Q5NCC3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Trim41Q5NCC3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Trim41Q5NCC3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Trim41Q5NCC3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Trim41Q5NCC3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Trim41Q5NCC3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Trim41Q5NCC3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Trim41Q5NCC3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Trim41Q5NCC3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Trim41Q5NCC3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Trim41Q5NCC3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Trim41Q5NCC3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Trim41Q5NCC3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Trim41Q5NCC3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Trim41Q5NCC3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Trim41Q5NCC3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Trim41Q5NCC3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Trim41Q5NCC3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Trim41Q5NCC3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Trim41Q5NCC3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Trim41Q5NCC3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Trim41Q5NCC3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Trim41Q5NCC3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Trim41Q5NCC3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Trim41Q5NCC3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Trim41Q5NCC3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Trim41Q5NCC3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Trim41Q5NCC3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Trim41Q5NCC3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Trim41Q5NCC3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Trim41Q5NCC3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Trim41Q5NCC3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Trim41Q5NCC3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Trim41Q5NCC3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Trim41Q5NCC3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Trim41Q5NCC3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Trim41Q5NCC3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Trim41Q5NCC3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Trim41Q5NCC3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Trim41Q5NCC3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Trim41Q5NCC3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Trim41Q5NCC3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Trim41Q5NCC3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Trim41Q5NCC3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Trim41Q5NCC3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Trim41Q5NCC3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Trim41Q5NCC3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Trim41Q5NCC3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Trim41Q5NCC3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Trim41Q5NCC3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Trim41Q5NCC3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Trim41Q5NCC3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Trim41Q5NCC3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Trim41Q5NCC3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Trim41Q5NCC3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Trim41Q5NCC3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Trim41Q5NCC3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Trim41Q5NCC3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Trim41Q5NCC3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Trim41Q5NCC3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Trim41Q5NCC3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Trim41Q5NCC3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Trim41Q5NCC3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Trim41Q5NCC3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Trim41Q5NCC3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Trim41Q5NCC3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
Trim41Q5NCC3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Trim41Q5NCC3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Trim41Q5NCC3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Trim41Q5NCC3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Trim41Q5NCC3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Trim41Q5NCC3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Trim41Q5NCC3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
Trim41Q5NCC3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms