Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttf2Q5NC05 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttf2Q5NC05 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttf2Q5NC05 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttf2Q5NC05 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttf2Q5NC05 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttf2Q5NC05 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ttf2Q5NC05 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttf2Q5NC05 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttf2Q5NC05 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ttf2Q5NC05 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttf2Q5NC05 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttf2Q5NC05 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttf2Q5NC05 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttf2Q5NC05 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttf2Q5NC05 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttf2Q5NC05 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttf2Q5NC05 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ttf2Q5NC05 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttf2Q5NC05 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttf2Q5NC05 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttf2Q5NC05 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttf2Q5NC05 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttf2Q5NC05 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttf2Q5NC05 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttf2Q5NC05 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttf2Q5NC05 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttf2Q5NC05 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttf2Q5NC05 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttf2Q5NC05 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttf2Q5NC05 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ttf2Q5NC05 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttf2Q5NC05 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttf2Q5NC05 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttf2Q5NC05 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttf2Q5NC05 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttf2Q5NC05 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttf2Q5NC05 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttf2Q5NC05 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttf2Q5NC05 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttf2Q5NC05 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttf2Q5NC05 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttf2Q5NC05 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttf2Q5NC05 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttf2Q5NC05 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ttf2Q5NC05 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttf2Q5NC05 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttf2Q5NC05 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ttf2Q5NC05 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttf2Q5NC05 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttf2Q5NC05 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttf2Q5NC05 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttf2Q5NC05 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttf2Q5NC05 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttf2Q5NC05 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttf2Q5NC05 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttf2Q5NC05 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttf2Q5NC05 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttf2Q5NC05 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ttf2Q5NC05 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttf2Q5NC05 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttf2Q5NC05 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttf2Q5NC05 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttf2Q5NC05 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttf2Q5NC05 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttf2Q5NC05 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttf2Q5NC05 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttf2Q5NC05 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttf2Q5NC05 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttf2Q5NC05 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ttf2Q5NC05 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttf2Q5NC05 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttf2Q5NC05 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttf2Q5NC05 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttf2Q5NC05 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttf2Q5NC05 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttf2Q5NC05 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttf2Q5NC05 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ttf2Q5NC05 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttf2Q5NC05 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttf2Q5NC05 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttf2Q5NC05 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttf2Q5NC05 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttf2Q5NC05 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttf2Q5NC05 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttf2Q5NC05 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttf2Q5NC05 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ttf2Q5NC05 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ttf2Q5NC05 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ttf2Q5NC05 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ttf2Q5NC05 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ttf2Q5NC05 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ttf2Q5NC05 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ttf2Q5NC05 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ttf2Q5NC05 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ttf2Q5NC05 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ttf2Q5NC05 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ttf2Q5NC05 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ttf2Q5NC05 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ttf2Q5NC05 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms