Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBX1

Cobl, Protein cordon-bleu, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CoblQ5NBX1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CoblQ5NBX1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CoblQ5NBX1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CoblQ5NBX1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CoblQ5NBX1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CoblQ5NBX1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CoblQ5NBX1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CoblQ5NBX1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CoblQ5NBX1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CoblQ5NBX1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CoblQ5NBX1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CoblQ5NBX1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CoblQ5NBX1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CoblQ5NBX1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CoblQ5NBX1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CoblQ5NBX1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CoblQ5NBX1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CoblQ5NBX1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CoblQ5NBX1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CoblQ5NBX1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CoblQ5NBX1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CoblQ5NBX1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CoblQ5NBX1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CoblQ5NBX1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CoblQ5NBX1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CoblQ5NBX1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CoblQ5NBX1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CoblQ5NBX1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CoblQ5NBX1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CoblQ5NBX1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CoblQ5NBX1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CoblQ5NBX1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CoblQ5NBX1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CoblQ5NBX1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CoblQ5NBX1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CoblQ5NBX1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CoblQ5NBX1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CoblQ5NBX1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CoblQ5NBX1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CoblQ5NBX1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CoblQ5NBX1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CoblQ5NBX1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CoblQ5NBX1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CoblQ5NBX1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CoblQ5NBX1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CoblQ5NBX1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CoblQ5NBX1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CoblQ5NBX1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CoblQ5NBX1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CoblQ5NBX1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CoblQ5NBX1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CoblQ5NBX1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CoblQ5NBX1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CoblQ5NBX1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CoblQ5NBX1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CoblQ5NBX1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CoblQ5NBX1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CoblQ5NBX1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CoblQ5NBX1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CoblQ5NBX1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CoblQ5NBX1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CoblQ5NBX1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CoblQ5NBX1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CoblQ5NBX1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CoblQ5NBX1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CoblQ5NBX1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CoblQ5NBX1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CoblQ5NBX1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CoblQ5NBX1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CoblQ5NBX1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CoblQ5NBX1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CoblQ5NBX1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CoblQ5NBX1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CoblQ5NBX1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CoblQ5NBX1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CoblQ5NBX1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CoblQ5NBX1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CoblQ5NBX1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CoblQ5NBX1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CoblQ5NBX1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CoblQ5NBX1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CoblQ5NBX1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CoblQ5NBX1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CoblQ5NBX1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CoblQ5NBX1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CoblQ5NBX1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CoblQ5NBX1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CoblQ5NBX1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CoblQ5NBX1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CoblQ5NBX1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CoblQ5NBX1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CoblQ5NBX1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CoblQ5NBX1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CoblQ5NBX1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CoblQ5NBX1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CoblQ5NBX1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CoblQ5NBX1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CoblQ5NBX1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CoblQ5NBX1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CoblQ5NBX1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms