Protein–RNA interactions for Protein: Q5I043

Usp28, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 28, mousemouse

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp28Q5I043 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp28Q5I043 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp28Q5I043 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp28Q5I043 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp28Q5I043 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp28Q5I043 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp28Q5I043 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp28Q5I043 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp28Q5I043 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp28Q5I043 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp28Q5I043 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp28Q5I043 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp28Q5I043 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp28Q5I043 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp28Q5I043 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp28Q5I043 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp28Q5I043 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp28Q5I043 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp28Q5I043 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp28Q5I043 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp28Q5I043 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp28Q5I043 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp28Q5I043 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp28Q5I043 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp28Q5I043 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp28Q5I043 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp28Q5I043 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp28Q5I043 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp28Q5I043 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp28Q5I043 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp28Q5I043 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp28Q5I043 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp28Q5I043 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp28Q5I043 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp28Q5I043 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp28Q5I043 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp28Q5I043 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp28Q5I043 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp28Q5I043 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp28Q5I043 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp28Q5I043 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp28Q5I043 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp28Q5I043 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp28Q5I043 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp28Q5I043 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp28Q5I043 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp28Q5I043 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp28Q5I043 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp28Q5I043 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp28Q5I043 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp28Q5I043 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp28Q5I043 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp28Q5I043 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp28Q5I043 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp28Q5I043 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp28Q5I043 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp28Q5I043 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp28Q5I043 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp28Q5I043 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp28Q5I043 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp28Q5I043 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp28Q5I043 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp28Q5I043 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp28Q5I043 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp28Q5I043 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp28Q5I043 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp28Q5I043 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp28Q5I043 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp28Q5I043 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp28Q5I043 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp28Q5I043 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp28Q5I043 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp28Q5I043 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp28Q5I043 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp28Q5I043 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp28Q5I043 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp28Q5I043 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp28Q5I043 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp28Q5I043 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp28Q5I043 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp28Q5I043 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp28Q5I043 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp28Q5I043 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp28Q5I043 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp28Q5I043 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp28Q5I043 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp28Q5I043 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp28Q5I043 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp28Q5I043 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp28Q5I043 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp28Q5I043 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp28Q5I043 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp28Q5I043 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp28Q5I043 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp28Q5I043 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp28Q5I043 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp28Q5I043 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp28Q5I043 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp28Q5I043 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp28Q5I043 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms