Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf3Q5HZG4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Taf3Q5HZG4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Taf3Q5HZG4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Taf3Q5HZG4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Taf3Q5HZG4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Taf3Q5HZG4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Taf3Q5HZG4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Taf3Q5HZG4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Taf3Q5HZG4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms