Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZGD9

Nxf3, Nuclear RNA export factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxf3Q4ZGD9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nxf3Q4ZGD9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nxf3Q4ZGD9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nxf3Q4ZGD9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nxf3Q4ZGD9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nxf3Q4ZGD9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nxf3Q4ZGD9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nxf3Q4ZGD9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nxf3Q4ZGD9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nxf3Q4ZGD9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nxf3Q4ZGD9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nxf3Q4ZGD9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nxf3Q4ZGD9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nxf3Q4ZGD9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nxf3Q4ZGD9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nxf3Q4ZGD9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nxf3Q4ZGD9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nxf3Q4ZGD9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nxf3Q4ZGD9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nxf3Q4ZGD9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nxf3Q4ZGD9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nxf3Q4ZGD9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nxf3Q4ZGD9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nxf3Q4ZGD9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nxf3Q4ZGD9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nxf3Q4ZGD9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nxf3Q4ZGD9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nxf3Q4ZGD9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nxf3Q4ZGD9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nxf3Q4ZGD9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nxf3Q4ZGD9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nxf3Q4ZGD9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nxf3Q4ZGD9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nxf3Q4ZGD9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nxf3Q4ZGD9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nxf3Q4ZGD9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nxf3Q4ZGD9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nxf3Q4ZGD9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nxf3Q4ZGD9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nxf3Q4ZGD9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nxf3Q4ZGD9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nxf3Q4ZGD9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nxf3Q4ZGD9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nxf3Q4ZGD9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nxf3Q4ZGD9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nxf3Q4ZGD9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nxf3Q4ZGD9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nxf3Q4ZGD9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nxf3Q4ZGD9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nxf3Q4ZGD9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nxf3Q4ZGD9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nxf3Q4ZGD9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nxf3Q4ZGD9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nxf3Q4ZGD9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nxf3Q4ZGD9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nxf3Q4ZGD9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nxf3Q4ZGD9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nxf3Q4ZGD9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nxf3Q4ZGD9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nxf3Q4ZGD9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nxf3Q4ZGD9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nxf3Q4ZGD9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nxf3Q4ZGD9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nxf3Q4ZGD9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nxf3Q4ZGD9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nxf3Q4ZGD9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nxf3Q4ZGD9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nxf3Q4ZGD9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nxf3Q4ZGD9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nxf3Q4ZGD9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nxf3Q4ZGD9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nxf3Q4ZGD9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nxf3Q4ZGD9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nxf3Q4ZGD9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nxf3Q4ZGD9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nxf3Q4ZGD9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nxf3Q4ZGD9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nxf3Q4ZGD9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nxf3Q4ZGD9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nxf3Q4ZGD9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nxf3Q4ZGD9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nxf3Q4ZGD9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nxf3Q4ZGD9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nxf3Q4ZGD9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nxf3Q4ZGD9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nxf3Q4ZGD9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nxf3Q4ZGD9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nxf3Q4ZGD9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nxf3Q4ZGD9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nxf3Q4ZGD9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nxf3Q4ZGD9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nxf3Q4ZGD9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nxf3Q4ZGD9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nxf3Q4ZGD9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nxf3Q4ZGD9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nxf3Q4ZGD9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nxf3Q4ZGD9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nxf3Q4ZGD9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nxf3Q4ZGD9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nxf3Q4ZGD9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155.4 ms