Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc84Q4VA36 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc84Q4VA36 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc84Q4VA36 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc84Q4VA36 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc84Q4VA36 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc84Q4VA36 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc84Q4VA36 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc84Q4VA36 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc84Q4VA36 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc84Q4VA36 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc84Q4VA36 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc84Q4VA36 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc84Q4VA36 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc84Q4VA36 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc84Q4VA36 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc84Q4VA36 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc84Q4VA36 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc84Q4VA36 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc84Q4VA36 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc84Q4VA36 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc84Q4VA36 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc84Q4VA36 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc84Q4VA36 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc84Q4VA36 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc84Q4VA36 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc84Q4VA36 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc84Q4VA36 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc84Q4VA36 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc84Q4VA36 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc84Q4VA36 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc84Q4VA36 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc84Q4VA36 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc84Q4VA36 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc84Q4VA36 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms