Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhox3aQ4TU90 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhox3aQ4TU90 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhox3aQ4TU90 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhox3aQ4TU90 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhox3aQ4TU90 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhox3aQ4TU90 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhox3aQ4TU90 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhox3aQ4TU90 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhox3aQ4TU90 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhox3aQ4TU90 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhox3aQ4TU90 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhox3aQ4TU90 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhox3aQ4TU90 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhox3aQ4TU90 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhox3aQ4TU90 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhox3aQ4TU90 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhox3aQ4TU90 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhox3aQ4TU90 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhox3aQ4TU90 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhox3aQ4TU90 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhox3aQ4TU90 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhox3aQ4TU90 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rhox3aQ4TU90 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Rhox3aQ4TU90 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rhox3aQ4TU90 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rhox3aQ4TU90 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rhox3aQ4TU90 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rhox3aQ4TU90 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rhox3aQ4TU90 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rhox3aQ4TU90 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rhox3aQ4TU90 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rhox3aQ4TU90 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rhox3aQ4TU90 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rhox3aQ4TU90 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Rhox3aQ4TU90 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rhox3aQ4TU90 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms