Protein–RNA interactions for Protein: Q499D0

Foxn3, Forkhead box protein N3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn3Q499D0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Foxn3Q499D0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Foxn3Q499D0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Foxn3Q499D0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Foxn3Q499D0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Foxn3Q499D0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Foxn3Q499D0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Foxn3Q499D0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Foxn3Q499D0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Foxn3Q499D0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Foxn3Q499D0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Foxn3Q499D0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Foxn3Q499D0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Foxn3Q499D0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Foxn3Q499D0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Foxn3Q499D0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Foxn3Q499D0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Foxn3Q499D0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Foxn3Q499D0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Foxn3Q499D0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Foxn3Q499D0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Foxn3Q499D0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Foxn3Q499D0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Foxn3Q499D0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Foxn3Q499D0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Foxn3Q499D0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Foxn3Q499D0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Foxn3Q499D0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Foxn3Q499D0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Foxn3Q499D0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Foxn3Q499D0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Foxn3Q499D0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Foxn3Q499D0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Foxn3Q499D0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Foxn3Q499D0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Foxn3Q499D0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Foxn3Q499D0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Foxn3Q499D0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Foxn3Q499D0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Foxn3Q499D0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Foxn3Q499D0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Foxn3Q499D0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Foxn3Q499D0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Foxn3Q499D0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Foxn3Q499D0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Foxn3Q499D0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Foxn3Q499D0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Foxn3Q499D0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms