Protein–RNA interactions for Protein: Q3V460

Smim26, Gene model 561, (NCBI), mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim26Q3V460 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim26Q3V460 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim26Q3V460 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim26Q3V460 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim26Q3V460 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim26Q3V460 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smim26Q3V460 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim26Q3V460 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms