Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc185Q3V118 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc185Q3V118 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc185Q3V118 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc185Q3V118 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc185Q3V118 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc185Q3V118 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc185Q3V118 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc185Q3V118 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc185Q3V118 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc185Q3V118 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc185Q3V118 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc185Q3V118 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc185Q3V118 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc185Q3V118 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc185Q3V118 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc185Q3V118 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc185Q3V118 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc185Q3V118 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc185Q3V118 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc185Q3V118 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc185Q3V118 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc185Q3V118 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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Ccdc185Q3V118 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc185Q3V118 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc185Q3V118 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc185Q3V118 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc185Q3V118 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc185Q3V118 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc185Q3V118 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc185Q3V118 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc185Q3V118 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc185Q3V118 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc185Q3V118 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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Ccdc185Q3V118 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc185Q3V118 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc185Q3V118 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc185Q3V118 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc185Q3V118 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc185Q3V118 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc185Q3V118 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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Ccdc185Q3V118 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc185Q3V118 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc185Q3V118 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc185Q3V118 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc185Q3V118 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc185Q3V118 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc185Q3V118 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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Ccdc185Q3V118 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc185Q3V118 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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Ccdc185Q3V118 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc185Q3V118 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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Ccdc185Q3V118 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc185Q3V118 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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Ccdc185Q3V118 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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Ccdc185Q3V118 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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Ccdc185Q3V118 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc185Q3V118 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc185Q3V118 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc185Q3V118 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc185Q3V118 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc185Q3V118 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc185Q3V118 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc185Q3V118 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc185Q3V118 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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Ccdc185Q3V118 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc185Q3V118 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc185Q3V118 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc185Q3V118 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc185Q3V118 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc185Q3V118 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc185Q3V118 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc185Q3V118 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc185Q3V118 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc185Q3V118 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc185Q3V118 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc185Q3V118 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc185Q3V118 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc185Q3V118 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc185Q3V118 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc185Q3V118 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc185Q3V118 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc185Q3V118 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc185Q3V118 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc185Q3V118 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc185Q3V118 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc185Q3V118 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
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