Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0V0

Ldlrad2, Low density lipoprotein receptor A domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldlrad2Q3V0V0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ldlrad2Q3V0V0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ldlrad2Q3V0V0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ldlrad2Q3V0V0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ldlrad2Q3V0V0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ldlrad2Q3V0V0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ldlrad2Q3V0V0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ldlrad2Q3V0V0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ldlrad2Q3V0V0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms