Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp48Q3V0C5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp48Q3V0C5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp48Q3V0C5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp48Q3V0C5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Usp48Q3V0C5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp48Q3V0C5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp48Q3V0C5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp48Q3V0C5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp48Q3V0C5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp48Q3V0C5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp48Q3V0C5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Usp48Q3V0C5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp48Q3V0C5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp48Q3V0C5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp48Q3V0C5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp48Q3V0C5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp48Q3V0C5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp48Q3V0C5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Usp48Q3V0C5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp48Q3V0C5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp48Q3V0C5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp48Q3V0C5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Usp48Q3V0C5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp48Q3V0C5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp48Q3V0C5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp48Q3V0C5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp48Q3V0C5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp48Q3V0C5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp48Q3V0C5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp48Q3V0C5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp48Q3V0C5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Usp48Q3V0C5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Usp48Q3V0C5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp48Q3V0C5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp48Q3V0C5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp48Q3V0C5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp48Q3V0C5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp48Q3V0C5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Usp48Q3V0C5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp48Q3V0C5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp48Q3V0C5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp48Q3V0C5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp48Q3V0C5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp48Q3V0C5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp48Q3V0C5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp48Q3V0C5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp48Q3V0C5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp48Q3V0C5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp48Q3V0C5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp48Q3V0C5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp48Q3V0C5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp48Q3V0C5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp48Q3V0C5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp48Q3V0C5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp48Q3V0C5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp48Q3V0C5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp48Q3V0C5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp48Q3V0C5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp48Q3V0C5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp48Q3V0C5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp48Q3V0C5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp48Q3V0C5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp48Q3V0C5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp48Q3V0C5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp48Q3V0C5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp48Q3V0C5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp48Q3V0C5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp48Q3V0C5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp48Q3V0C5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp48Q3V0C5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp48Q3V0C5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp48Q3V0C5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp48Q3V0C5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp48Q3V0C5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp48Q3V0C5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp48Q3V0C5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp48Q3V0C5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp48Q3V0C5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp48Q3V0C5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp48Q3V0C5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp48Q3V0C5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp48Q3V0C5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp48Q3V0C5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp48Q3V0C5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp48Q3V0C5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp48Q3V0C5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp48Q3V0C5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp48Q3V0C5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp48Q3V0C5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp48Q3V0C5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp48Q3V0C5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp48Q3V0C5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp48Q3V0C5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp48Q3V0C5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp48Q3V0C5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp48Q3V0C5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp48Q3V0C5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp48Q3V0C5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp48Q3V0C5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms