Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW77

Gm12888, MCG59630, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12888Q3UW77 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm12888Q3UW77 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gm12888Q3UW77 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm12888Q3UW77 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm12888Q3UW77 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm12888Q3UW77 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Gm12888Q3UW77 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm12888Q3UW77 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Gm12888Q3UW77 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm12888Q3UW77 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm12888Q3UW77 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Gm12888Q3UW77 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Gm12888Q3UW77 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm12888Q3UW77 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm12888Q3UW77 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm12888Q3UW77 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm12888Q3UW77 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm12888Q3UW77 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm12888Q3UW77 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm12888Q3UW77 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm12888Q3UW77 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm12888Q3UW77 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm12888Q3UW77 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm12888Q3UW77 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm12888Q3UW77 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gm12888Q3UW77 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gm12888Q3UW77 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm12888Q3UW77 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm12888Q3UW77 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gm12888Q3UW77 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gm12888Q3UW77 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gm12888Q3UW77 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm12888Q3UW77 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm12888Q3UW77 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm12888Q3UW77 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm12888Q3UW77 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm12888Q3UW77 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm12888Q3UW77 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm12888Q3UW77 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm12888Q3UW77 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm12888Q3UW77 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm12888Q3UW77 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm12888Q3UW77 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm12888Q3UW77 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm12888Q3UW77 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Gm12888Q3UW77 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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