Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capn13Q3UW68 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capn13Q3UW68 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Capn13Q3UW68 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Capn13Q3UW68 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capn13Q3UW68 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capn13Q3UW68 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capn13Q3UW68 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capn13Q3UW68 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capn13Q3UW68 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capn13Q3UW68 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capn13Q3UW68 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capn13Q3UW68 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capn13Q3UW68 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Capn13Q3UW68 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capn13Q3UW68 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capn13Q3UW68 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capn13Q3UW68 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capn13Q3UW68 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Capn13Q3UW68 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Capn13Q3UW68 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Capn13Q3UW68 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Capn13Q3UW68 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Capn13Q3UW68 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Capn13Q3UW68 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Capn13Q3UW68 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Capn13Q3UW68 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Capn13Q3UW68 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Capn13Q3UW68 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Capn13Q3UW68 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Capn13Q3UW68 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Capn13Q3UW68 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Capn13Q3UW68 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Capn13Q3UW68 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Capn13Q3UW68 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms