Protein–RNA interactions for Protein: Q3USY0

Slc38a11, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 11, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a11Q3USY0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc38a11Q3USY0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc38a11Q3USY0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc38a11Q3USY0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc38a11Q3USY0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc38a11Q3USY0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc38a11Q3USY0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc38a11Q3USY0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc38a11Q3USY0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc38a11Q3USY0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc38a11Q3USY0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc38a11Q3USY0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc38a11Q3USY0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc38a11Q3USY0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc38a11Q3USY0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc38a11Q3USY0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc38a11Q3USY0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc38a11Q3USY0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc38a11Q3USY0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc38a11Q3USY0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc38a11Q3USY0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc38a11Q3USY0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Slc38a11Q3USY0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Slc38a11Q3USY0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc38a11Q3USY0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Slc38a11Q3USY0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms