Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Acsf3Q3URE1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acsf3Q3URE1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms