Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR9

Sbspon, Somatomedin-B and thrombospondin type-1 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsponQ3UPR9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SbsponQ3UPR9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SbsponQ3UPR9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SbsponQ3UPR9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SbsponQ3UPR9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SbsponQ3UPR9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SbsponQ3UPR9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SbsponQ3UPR9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SbsponQ3UPR9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SbsponQ3UPR9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SbsponQ3UPR9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SbsponQ3UPR9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SbsponQ3UPR9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SbsponQ3UPR9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SbsponQ3UPR9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SbsponQ3UPR9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SbsponQ3UPR9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SbsponQ3UPR9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SbsponQ3UPR9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SbsponQ3UPR9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SbsponQ3UPR9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SbsponQ3UPR9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SbsponQ3UPR9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SbsponQ3UPR9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SbsponQ3UPR9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SbsponQ3UPR9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SbsponQ3UPR9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SbsponQ3UPR9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SbsponQ3UPR9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SbsponQ3UPR9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SbsponQ3UPR9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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