Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nhlrc4Q3UP44 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nhlrc4Q3UP44 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nhlrc4Q3UP44 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nhlrc4Q3UP44 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nhlrc4Q3UP44 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nhlrc4Q3UP44 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nhlrc4Q3UP44 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nhlrc4Q3UP44 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nhlrc4Q3UP44 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nhlrc4Q3UP44 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nhlrc4Q3UP44 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nhlrc4Q3UP44 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nhlrc4Q3UP44 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nhlrc4Q3UP44 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nhlrc4Q3UP44 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nhlrc4Q3UP44 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nhlrc4Q3UP44 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nhlrc4Q3UP44 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nhlrc4Q3UP44 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nhlrc4Q3UP44 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nhlrc4Q3UP44 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nhlrc4Q3UP44 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nhlrc4Q3UP44 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nhlrc4Q3UP44 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nhlrc4Q3UP44 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nhlrc4Q3UP44 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nhlrc4Q3UP44 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nhlrc4Q3UP44 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nhlrc4Q3UP44 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nhlrc4Q3UP44 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nhlrc4Q3UP44 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nhlrc4Q3UP44 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nhlrc4Q3UP44 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nhlrc4Q3UP44 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nhlrc4Q3UP44 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nhlrc4Q3UP44 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nhlrc4Q3UP44 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nhlrc4Q3UP44 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nhlrc4Q3UP44 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nhlrc4Q3UP44 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nhlrc4Q3UP44 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nhlrc4Q3UP44 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms