Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cobll1Q3UMF0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cobll1Q3UMF0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms