Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM18

Lsg1, Large subunit GTPase 1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsg1Q3UM18 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lsg1Q3UM18 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lsg1Q3UM18 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lsg1Q3UM18 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lsg1Q3UM18 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lsg1Q3UM18 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lsg1Q3UM18 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lsg1Q3UM18 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lsg1Q3UM18 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lsg1Q3UM18 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lsg1Q3UM18 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lsg1Q3UM18 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lsg1Q3UM18 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lsg1Q3UM18 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lsg1Q3UM18 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lsg1Q3UM18 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lsg1Q3UM18 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lsg1Q3UM18 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lsg1Q3UM18 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lsg1Q3UM18 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lsg1Q3UM18 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lsg1Q3UM18 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms