Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW8

Parp3, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp3Q3ULW8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Parp3Q3ULW8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Parp3Q3ULW8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Parp3Q3ULW8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Parp3Q3ULW8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Parp3Q3ULW8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Parp3Q3ULW8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Parp3Q3ULW8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Parp3Q3ULW8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Parp3Q3ULW8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Parp3Q3ULW8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Parp3Q3ULW8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Parp3Q3ULW8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Parp3Q3ULW8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Parp3Q3ULW8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Parp3Q3ULW8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Parp3Q3ULW8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Parp3Q3ULW8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Parp3Q3ULW8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Parp3Q3ULW8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Parp3Q3ULW8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Parp3Q3ULW8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Parp3Q3ULW8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Parp3Q3ULW8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Parp3Q3ULW8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Parp3Q3ULW8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Parp3Q3ULW8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Parp3Q3ULW8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Parp3Q3ULW8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Parp3Q3ULW8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Parp3Q3ULW8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Parp3Q3ULW8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Parp3Q3ULW8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Parp3Q3ULW8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Parp3Q3ULW8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Parp3Q3ULW8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Parp3Q3ULW8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Parp3Q3ULW8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Parp3Q3ULW8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Parp3Q3ULW8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Parp3Q3ULW8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Parp3Q3ULW8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Parp3Q3ULW8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Parp3Q3ULW8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Parp3Q3ULW8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Parp3Q3ULW8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Parp3Q3ULW8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Parp3Q3ULW8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Parp3Q3ULW8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Parp3Q3ULW8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Parp3Q3ULW8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Parp3Q3ULW8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Parp3Q3ULW8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Parp3Q3ULW8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Parp3Q3ULW8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Parp3Q3ULW8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Parp3Q3ULW8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Parp3Q3ULW8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Parp3Q3ULW8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Parp3Q3ULW8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Parp3Q3ULW8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Parp3Q3ULW8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Parp3Q3ULW8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Parp3Q3ULW8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Parp3Q3ULW8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Parp3Q3ULW8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Parp3Q3ULW8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Parp3Q3ULW8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Parp3Q3ULW8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Parp3Q3ULW8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Parp3Q3ULW8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Parp3Q3ULW8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Parp3Q3ULW8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Parp3Q3ULW8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Parp3Q3ULW8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Parp3Q3ULW8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Parp3Q3ULW8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Parp3Q3ULW8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Parp3Q3ULW8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Parp3Q3ULW8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Parp3Q3ULW8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Parp3Q3ULW8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Parp3Q3ULW8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Parp3Q3ULW8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Parp3Q3ULW8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Parp3Q3ULW8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Parp3Q3ULW8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Parp3Q3ULW8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Parp3Q3ULW8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Parp3Q3ULW8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Parp3Q3ULW8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Parp3Q3ULW8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Parp3Q3ULW8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Parp3Q3ULW8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Parp3Q3ULW8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Parp3Q3ULW8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Parp3Q3ULW8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Parp3Q3ULW8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Parp3Q3ULW8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Parp3Q3ULW8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms