Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULP7

Ctsll3, Cathepsin L-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctsll3Q3ULP7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctsll3Q3ULP7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctsll3Q3ULP7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctsll3Q3ULP7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctsll3Q3ULP7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctsll3Q3ULP7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctsll3Q3ULP7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctsll3Q3ULP7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctsll3Q3ULP7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctsll3Q3ULP7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctsll3Q3ULP7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctsll3Q3ULP7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctsll3Q3ULP7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctsll3Q3ULP7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctsll3Q3ULP7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctsll3Q3ULP7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctsll3Q3ULP7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctsll3Q3ULP7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctsll3Q3ULP7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctsll3Q3ULP7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctsll3Q3ULP7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctsll3Q3ULP7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctsll3Q3ULP7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctsll3Q3ULP7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctsll3Q3ULP7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctsll3Q3ULP7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctsll3Q3ULP7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctsll3Q3ULP7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctsll3Q3ULP7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctsll3Q3ULP7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctsll3Q3ULP7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctsll3Q3ULP7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctsll3Q3ULP7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctsll3Q3ULP7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctsll3Q3ULP7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctsll3Q3ULP7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctsll3Q3ULP7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctsll3Q3ULP7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctsll3Q3ULP7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctsll3Q3ULP7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctsll3Q3ULP7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctsll3Q3ULP7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctsll3Q3ULP7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms