Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKK2

Ceacam5, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 5, mousemouse

Predictions only

Length 947 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam5Q3UKK2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ceacam5Q3UKK2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ceacam5Q3UKK2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ceacam5Q3UKK2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ceacam5Q3UKK2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ceacam5Q3UKK2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ceacam5Q3UKK2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ceacam5Q3UKK2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ceacam5Q3UKK2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ceacam5Q3UKK2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ceacam5Q3UKK2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ceacam5Q3UKK2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ceacam5Q3UKK2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ceacam5Q3UKK2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ceacam5Q3UKK2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ceacam5Q3UKK2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ceacam5Q3UKK2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ceacam5Q3UKK2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ceacam5Q3UKK2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ceacam5Q3UKK2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ceacam5Q3UKK2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ceacam5Q3UKK2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ceacam5Q3UKK2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ceacam5Q3UKK2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ceacam5Q3UKK2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ceacam5Q3UKK2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ceacam5Q3UKK2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ceacam5Q3UKK2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ceacam5Q3UKK2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ceacam5Q3UKK2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ceacam5Q3UKK2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ceacam5Q3UKK2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ceacam5Q3UKK2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ceacam5Q3UKK2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ceacam5Q3UKK2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ceacam5Q3UKK2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ceacam5Q3UKK2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ceacam5Q3UKK2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ceacam5Q3UKK2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ceacam5Q3UKK2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ceacam5Q3UKK2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ceacam5Q3UKK2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ceacam5Q3UKK2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ceacam5Q3UKK2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ceacam5Q3UKK2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ceacam5Q3UKK2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ceacam5Q3UKK2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ceacam5Q3UKK2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ceacam5Q3UKK2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ceacam5Q3UKK2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ceacam5Q3UKK2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ceacam5Q3UKK2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ceacam5Q3UKK2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ceacam5Q3UKK2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ceacam5Q3UKK2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ceacam5Q3UKK2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ceacam5Q3UKK2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ceacam5Q3UKK2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ceacam5Q3UKK2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ceacam5Q3UKK2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ceacam5Q3UKK2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ceacam5Q3UKK2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ceacam5Q3UKK2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ceacam5Q3UKK2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ceacam5Q3UKK2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ceacam5Q3UKK2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ceacam5Q3UKK2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ceacam5Q3UKK2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ceacam5Q3UKK2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ceacam5Q3UKK2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ceacam5Q3UKK2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ceacam5Q3UKK2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ceacam5Q3UKK2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ceacam5Q3UKK2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ceacam5Q3UKK2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ceacam5Q3UKK2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ceacam5Q3UKK2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ceacam5Q3UKK2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ceacam5Q3UKK2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ceacam5Q3UKK2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ceacam5Q3UKK2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ceacam5Q3UKK2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ceacam5Q3UKK2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ceacam5Q3UKK2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ceacam5Q3UKK2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ceacam5Q3UKK2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ceacam5Q3UKK2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ceacam5Q3UKK2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ceacam5Q3UKK2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ceacam5Q3UKK2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ceacam5Q3UKK2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ceacam5Q3UKK2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ceacam5Q3UKK2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ceacam5Q3UKK2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ceacam5Q3UKK2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ceacam5Q3UKK2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ceacam5Q3UKK2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ceacam5Q3UKK2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ceacam5Q3UKK2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ceacam5Q3UKK2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms